总督和巡抚合称“督抚”，都是从明朝开始设置的。起初仅用兵时派为总督军务；成化五年(1469年)，专设两广总督，以后逐渐增置。那时，政府派大臣处置地方军政事务，有两种头衔，全称分别是“总督某地等处地方提督军务粮饷兼巡抚事”和“巡抚某地等处地方提督军务兼理粮饷”，前者就是总督，后者就是巡抚，都属于临时性质，事罢还朝。

清朝时，正式以督抚为地方最高长官。总督管辖一省或二、三省，冶理辖区内的军民要政。巡抚是省级地方长官，总揽一省的军事、吏治、刑狱等事。鸦片战争(1840年)前，清朝全国有八总督：直隶总督、两江总督、陕甘总督、湖广总督、两广总督、闽浙总督、四川总督、云贵总督。公元1906年增设东北总督。

直隶、四川两省只设总督，不设巡抚。甘肃巡抚于1754年撤去，由陕甘总督兼任。公元1884年，增设新疆省，开始设甘肃新疆巡抚，驻乌鲁木齐。公元1885年，增设台湾省，改福建巡抚为台湾巡抚，驻台北，福建巡抚由闽浙总督兼任。其余各省则督抚并置。

地方官中与总督职司平行而地位略低半级的，是巡抚，只管一个省。总督的官品高于巡抚。

总督，全衔一般为“总督某某等处地方，提督军务、粮饷，兼巡抚事”，根据职责不同，少数总督全衔有所变化，如直隶总督还加上“管理河道”，两江总督加上“操江、统辖南河事务”，陕甘总督加“管理茶马”。总督系正二品官，加尚书衔为从一品，一般称“部堂”、“制台”、“制军”；加大学士衔为正一品，可与大学士一样称“中堂”。其职责为“掌总治军民，统辖文武、考核官吏，修饬封疆”，因此，清代定例各省总督加兵部尚书、都察院右都御史衔，不加尚书衔者，俱加兵部右侍郎、都察院右副都御史衔。

一、直隶总督

辖直隶省，治保定天津；地位最高，为总督之首，后来直隶总督又兼北洋大臣，权势更重； 直隶总督在同治三年(1864年)加钦差大臣、三口通商事务，授为北洋通商大臣，常驻天津，冬天还驻保定。

直隶总督的前身是设于顺治五年(1648年)的直隶山东河南三省总督，当时预定的总督府设在直隶大名府。(直隶总督——顺治5年至15年)

顺治十五年(1658年)，降为直隶巡抚。顺治十八年(1661年)，复置直隶总督一职，驻地依旧位于大名。(直隶总督——顺治18年至康熙8年)

康熙八年(1669年)裁撤总督一职。

雍正元年(1723年)，重设直隶总督一职。(直隶总督——雍正元年至乾隆28年)

乾隆十四年(1749年)，直隶总督兼管黄河的防汛和治理工作。乾隆二十八年(1763年)，直隶总督兼任直隶省巡抚。(直隶总督兼巡抚——乾隆28年至同治9年)

咸丰三年(1854年)，长芦盐场的盐政划归直隶总督直辖。

同治九年(1870年)，清廷将天津、营口和烟台三个口岸的通商事宜，划归直隶总督管理，并将北洋通商大臣一衔授与直隶总督。自此直隶总督多驻在天津，在冬天外贸淡季，才回到保定。(直隶总督、巡抚兼北洋通商大臣——同治9年至清朝末年)

二、两江总督

辖江苏，安徽，江西三省，治南京，地位次之，晚清两江总督又兼南洋大臣，权势也日重。

两江，指江南省(今江苏、安徽两省及上海市)和江西省，是清王朝的财赋重地，也是人文荟萃之区。两江总督是地方最高长官，太平天国运动之前多由满人担任，之后汉人渐多。从康熙四年(1665)到宣统三年(1911)，有影响的计80余人，98任，历247年。两江总督署位于南京城正中，明汉王府旧址。

两江总督，正式官衔为总督两江等处地方提督军务、粮饷、操江、统辖南河事务，是清朝九位最高级的封疆大臣之一，总管江苏、安徽和江西三省的军民政务。由于清初江苏和安徽两省辖地同属江南省，因此初时该总督管辖的是江南和江西的政务，因此号两江总督。

该职的前身为顺治四年所设置的江南江西河南三省总督，总督府驻江宁。

顺治九年，总督府一度迁往南昌，改名江西总督，不过很快恢复旧制。顺治十八年和康熙十三年，江南、江西两度分置总督，不过在康熙四年和二十一年两省同归两江总督管辖。

康熙元年，操江事务划归江南总督管理，康熙二十一年仍合，正式定名为两江总督。

雍正元年，授与历任两江总督兵部尚书兼都察院右都御史之官衔。

道光十一年起，两江总督兼管两淮盐政。

自同治五年，历任两江总督兼管五口通商事务，授为南洋通商大臣。

三、陕甘总督

辖陕西，甘肃二省，治西安，地位较闽浙稍低，晚清左宗棠任陕甘总督时，陕甘地位只在直隶与两江之下，又当别论。

四、湖广总督

辖湖南、湖北二省，治武昌；两湖总督原为湖广总督，康熙二十六年(1687年)定名为湖北湖南总督，习惯上也称湖广总督。

湖广总督，正式官衔为总督湖北湖南等处地方提督军务、粮饷兼巡抚事，正式简称为湖北湖南总督，是清朝九位最高级的封疆大臣之一，总管湖北和湖南的军民政务。因湖南、湖北两省再明朝时同属湖广省，因此通称为湖广总督。

该职的前身为顺治元年所设置的湖广总督，总督府驻武昌。

康熙七年被废，九年再次设置。康熙十九年，改川湖总督复为湖广总督，还驻武昌。康熙二十六年，更名湖北湖南总督。

光绪三十年起，历任湖北湖南总督兼任湖北巡抚。

五、两广总督

辖广东、广西二省，治广州；湖广与两广地位相当，总督权势也相当，只是晚清两广地位日渐重要，地位在湖广之上。

两广总督，正式官衔为总督两广等处地方提督军务、粮饷兼巡抚事，是清朝九位最高级的封疆大臣之一，总管广东和广西两省的军民政务。

两广总督的前身为顺治元年所置的广东总督，当时总督驻广州，兼辖广西。

顺治十二年，总督府迁往梧州。

康熙二年，别置广西总督，广东总督移驻廉州。次年，撤销广西总督，广西政务复归广东总督管辖，广东总督迁驻肇庆。

雍正元年，重设广西总督，次年再次裁撤。雍正七年，为统一西南军事指挥权，镇压苗族起事，广西政务暂归云贵总督兼辖。雍正十二年，广西政务仍隶广东总督管辖，更号两广总督。

乾隆十一年，两广总督迁回驻广州。

光绪三十一年起，两广总督兼任广东巡抚。

六、闽浙总督

辖福建、浙江二省，治福州；总督闽浙等处地方提督军务、粮饷兼巡抚事。

顺治二年，设立福建总督，总督府驻福州，兼管浙江。顺治五年，改名为浙闽总督，总督府迁往衢州，仍兼管福建。顺治十五年，两省各设总督，福建总督府驻漳州，浙江总督府驻温州。

康熙十年，将福建总督府移往福州。次年，取消浙江总督。康熙二十六年，福建总督更名福建浙江总督。

雍正五年，特授李卫总督浙江，整饬军政吏治，并兼巡抚事；郝玉麟以浙闽总督专辖福建。十二年，又撤销浙江总督，仍合为一。

乾隆元年，诏依李卫例，特授嵇曾筠为浙江总督，郝玉麟仍专辖福建。三年，嵇曾筠入阁，郝玉麟仍总督闽、浙如故。闽、浙或分或合，至是始为永制。

光绪十一年起，取消福建巡抚，由闽浙总督兼任。光绪十一年(1885)，清朝正式设立台湾省，命刘铭传为首任台湾巡抚，归闽浙总督管辖，至此闽浙总督统管福建、浙江、台湾三省军民政务。

七、四川总督

辖四川省，治成都；四川总督就只管四川一省。四川总督，正式官衔为总督四川等处地方提督军务、粮饷兼巡抚事，是清朝九位最高级的封疆大臣之一，总管四川省的军民政务。

顺治元年，设立四川巡抚，驻扎在成都，不设置总督。顺治十年，因为四川省兵马钱粮皆从陕西调发，乃下诏陕西总督孟乔芳兼督四川。顺治十四年，停止陕西总督兼辖，专置四川总督，驻重庆。

康熙七年，更名为川湖总督，迁往荆州。康熙九年，又还驻重庆。康熙十三年，四川省别置总督一人。康熙十九年，四川省隶陕甘总督，其川湖总督取消，归湖广总督兼理。

雍正九年复置，驻成都。 雍正十三年又取消。

乾隆十三年，以金川用兵，始定为专缺，兼管巡抚事。乾隆二十四年，四川总督兼辖陕西，寻停兼辖。

宣统元年，以将军所辖松潘、建昌二镇，阜和协所属各营，建昌、松茂二道府、厅、州、县、改隶之。

八、云贵总督

辖云南，贵州二省，治昆明，地位最为低下为总督之末。云贵总督，正式官衔为总督云南，贵州两地提督军务、粮饷兼巡抚事，是清朝九位最高级的封疆大臣之一，总管云南、贵州两省的军民政务。

顺治十六年，设立经略，然后改设总督。

康熙元年，分别设立云南总督，总督府驻曲靖；贵州总督，总督府驻安顺。康熙三年，取消云南总督，由贵州总督兼任，总督府迁贵阳。康熙十二年，又恢复云南总督，总督府仍驻曲靖。康熙二十六年，云南总督府迁云南府。

雍正十年，云贵总督兼辖广西。 雍正十二年，云贵总督恢复掌管两省。

光绪三十一年，云贵总督兼任云南巡抚。

九、东北总督

光绪三十二年(1906年)增设，管辖黑龙江、吉林、奉天三省，治盛京。东北地区原为将军辖区，清末改革官制，于光绪三十三年(1907年)三月建立行省，设东三省总督以钦差大臣兼管三省将军事务之职任，为总理三省军政旗事务的最高军政长官。

东三省总督，正式官衔为总督东三省等处地方兼管三省将军、奉天巡抚事，是清朝九位最高级的封疆大臣之一，在清末总管奉天、吉林和黑龙江三省的军民政务。

前身为康熙元年所置的奉天将军。

光绪二年，加总督、兵部尚书和都察院右都御史的头衔。并且兼任奉天兵、刑二部尚书及奉天府尹。光绪三十二年，东北改制，三个将军辖区改建为行省，改奉天将军曰东三省总督，并加授钦差大臣的头衔，驻地分别为三省的省会。

宣统二年，兼任奉天巡抚。

清代历任东北总督有：

徐世昌：1907年6月12日～1909年2月8日任东三省总督

锡　良：1909年2月8日～1911年4月20日任东三省总督

赵尔巽：1911年4月20日～1912年2月12日任东三省总督

设置巡抚的省份有：直隶、陕西、山东、河南、江苏、安徽、江西、湖南、湖北、四川、山西、甘肃、福建、浙江、广东、广西、云南、贵州；后来又依次增设了新疆、台湾、黑龙江、吉林、奉天巡抚。共计二十三处。

除总督、巡抚之外，清政府还设有漕运、河道衙门，漕运总督、河道总督的品佚与各省巡抚一样，漕运总督如加尚书衔与各省总督一样为从一品。河道总督为正二品官，清朝共设北河、南河、东河三人，北河由直隶总督兼管，南河由漕运总督兼管，东河为专任，名为河东河道总督。漕运总督亲辖的军队称为“漕标”；河道总督亲辖的军队称为“河标”。